Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf4P43488 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tnfsf4P43488 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnfsf4P43488 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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