Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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