Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VhlP40338 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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VhlP40338 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VhlP40338 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
VhlP40338 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
VhlP40338 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VhlP40338 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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