Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprkP35822 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms