Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms