Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin1P35438 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin1P35438 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin1P35438 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin1P35438 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms