Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab20P35295 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab20P35295 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms