Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VtnP29788 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VtnP29788 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VtnP29788 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VtnP29788 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VtnP29788 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VtnP29788 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VtnP29788 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms