Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mmp3P28862 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms