Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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