Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col2a1P28481 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms