Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hoxd10P28359 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hoxd10P28359 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hoxd10P28359 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms