Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms