Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BrafP28028 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BrafP28028 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BrafP28028 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BrafP28028 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BrafP28028 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BrafP28028 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BrafP28028 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BrafP28028 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BrafP28028 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BrafP28028 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms