Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde6aP27664 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6aP27664 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms