Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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