Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms