Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RdxP26043 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RdxP26043 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RdxP26043 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RdxP26043 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RdxP26043 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RdxP26043 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RdxP26043 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms