Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UbtfP25976 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UbtfP25976 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms