Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms