Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm31463-201ENSMUST00000208799 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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