Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Ggta1P23336 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Ggta1P23336 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Ggta1P23336 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ggta1P23336 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Ggta1P23336 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Ggta1P23336 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ggta1P23336 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ggta1P23336 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ggta1P23336 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ggta1P23336 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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