Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms