Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms