Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bmp4P21275 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bmp4P21275 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bmp4P21275 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bmp4P21275 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bmp4P21275 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bmp4P21275 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms