Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VimP20152 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VimP20152 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VimP20152 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms