Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms