Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrgnP13609 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrgnP13609 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrgnP13609 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrgnP13609 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrgnP13609 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms