Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cd5P13379 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cd5P13379 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cd5P13379 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms