Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg5P12961 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg5P12961 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg5P12961 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg5P12961 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg5P12961 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg5P12961 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg5P12961 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg5P12961 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scg5P12961 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms