Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RapsnP12672 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RapsnP12672 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RapsnP12672 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms