Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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DmdP11531 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DmdP11531 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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DmdP11531 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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DmdP11531 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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DmdP11531 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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DmdP11531 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DmdP11531 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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