Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms