Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NefmP08553 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NefmP08553 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NefmP08553 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NefmP08553 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms