Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp1P08042 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms