Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms