Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01678 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01678 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01678 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01678 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01678 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P01678 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01678 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01678 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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P01678 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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P01678 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01678 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01678 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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