Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01672 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01672 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01672 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01672 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms