Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01664 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01664 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01664 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01664 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01664 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01664 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01664 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01664 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01664 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01664 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01664 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms