Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tcn2O88968 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms