Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ComtO88587 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ComtO88587 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ComtO88587 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ComtO88587 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ComtO88587 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ComtO88587 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ComtO88587 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ComtO88587 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ComtO88587 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ComtO88587 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ComtO88587 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ComtO88587 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ComtO88587 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ComtO88587 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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ComtO88587 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms