Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3aO88508 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms