Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SfnO70456 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SfnO70456 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SfnO70456 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SfnO70456 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SfnO70456 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SfnO70456 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms