Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma3O70435 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma3O70435 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma3O70435 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma3O70435 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma3O70435 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms