Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms