Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms