Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx4O55187 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx4O55187 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx4O55187 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx4O55187 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx4O55187 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cbx4O55187 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms