Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms