Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TsksO54887 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TsksO54887 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TsksO54887 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TsksO54887 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TsksO54887 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TsksO54887 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TsksO54887 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TsksO54887 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TsksO54887 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TsksO54887 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TsksO54887 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TsksO54887 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TsksO54887 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TsksO54887 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms