Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms